A Capes e o Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) fornecem uma cota de bolsas às faculdades, ou seja, cabe a elas distribuí-las entre alunos por meio de um processo de seleção. O CNPq também oferece bolsas individuais que podem ser solicitadas diretamente à entidade pelos candidatos, assim como os fundos estaduais de amparo à pesquisa (em São Paulo, quem se encarrega disso é a Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, Fapesp). Na maioria dos casos, o bolsista não pode estar empregado e precisa se dedicar integralmente aos estudos. Há ainda fundações, como a Fundação Ford, por exemplo, que também dão bolsas. Outra possibilidade é procurar faculdades conveniadas com bancos para financiar o mestrado.